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Inference of germinal center evolutionary dynamics via simulation-based deep learning

यह शोधपत्र बार-बार किए गए जर्मिनल सेंटर प्रयोगों के डेटा का विश्लेषण करके बी सेल आत्मीयता (B cell affinity) और प्रजनन क्षमता (fecundity) के बीच अज्ञात संबंध को निर्धारित करने के लिए डीप लर्निंग और सिमुलेशन-आधारित अनुमान (simulation-based inference) का उपयोग करता है, जिसे "एफिनिटी-फिटनेस रिस्पॉन्स फंक्शन" कहा जाता है।

Ralph, D. K., Bakis, A. G., Galloway, J., Vora, A. A., Araki, T., Song, Y. S., DeWitt, W. S., Matsen, F. A.2026-01-22
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Deciphering chromosome fusion in D. miranda's neo-sex chromosome through single-copy and repetitive oligo probes

यह अध्ययन *Drosophila miranda* के नव-लिंग गुणसूत्रों (neo-sex chromosomes) के व्यापक फ्लोरोसेंस इन सीटू हाइब्रिडाइजेशन पेंटिंग को सक्षम करने वाले नवीन एकल-प्रति (single-copy) और पुनरावृत्ति (repetitive) ओलिगो प्रोब पुस्तकों को डिजाइन और मान्य करने के लिए ओलिगोमाइनर (OligoMiner) और ओलिगोवाई (OligoY) पाइपलाइनों को एकीकृत करता है, जो ट्रांसलोकेशन (translocations) और इनवर्जन (inversions) जैसे जटिल विकासवादी तंत्रों को प्रकट करते हुए विविध जीनोमिक क्षेत्रों में गुणसूत्र गतिशीलता के अध्ययन के लिए एक सुदृढ़ उपकरण प्रदान करता है।

Bruno, H., Almeida, I., D. Vibranovski, M.2026-01-22
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Deconvolving Phylogenetic Distance Mixtures

यह शोध पत्र फाइलोगैनेटिक डिस्टेंस डीकनवोल्यूशन (PDD) समस्या और DecoDiPhy एल्गोरिदम को प्रस्तुत करता है, जो एक मल्टी-प्लेसमेंट दृष्टिकोण के माध्यम से डाउनस्ट्रीम सटीकता को बढ़ाने के लिए रीड्स को एक संदर्भ फाइलोजेनी पर समेकित करके विकासवादी निर्भरता और डेटा शोर को एक साथ संबोधित करते हुए मेटाजीनोमिक मिश्रण विश्लेषण में सुधार करते हैं।

Arasti, S., Sapci, A. O. B., Rachtman, E., El-Kebir, M., Mirarab, S.2026-01-21
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FastSpeciesTree: Fast and Scalable Species tree Inference

FastSpeciesTree एक पूर्णतः स्वचालित, सिंगल-कमांड टूल है जो जीनोमिक डेटा से बड़े पैमाने पर स्पीशीज़ ट्री को तेजी से और सटीक रूप से इन्फर करता है, जो मैनुअल क्यूरेशन के समान उच्च सटीकता बनाए रखते हुए गति में मौजूदा तरीकों से बेहतर प्रदर्शन करता है।

Holmes, J., Kelly, S.2026-01-21
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Successful strategies in the voluntarily repeated Prisoner's Dilemma

यह शोध पत्र यह प्रदर्शित करता है कि बार-बार होने वाले प्रिसनर्स डिलेमा (Prisoner's Dilemma) के वातावरण में, जो बार-बार रणनीति परिचय, व्यवहार संबंधी त्रुटियों और छोड़ने के विकल्प द्वारा अभिलक्षित है, सहयोग को 'टिट-फॉर-टैट' (Tit-for-Tat) जैसी शास्त्रीय प्रतिशोधात्मक रणनीतियों के माध्यम से नहीं, बल्कि पार्टनर-स्विचिंग (partner-switching) रणनीतियों के माध्यम से उच्च स्तरों पर बनाए रखा जाता है जो बाहर निकलकर धोखेबाजों को दंडित करती हैं।

Izquierdo, L. R., Izquierdo, S. S., Boyd, R. T.2026-01-20